Sophie Deshayes est diplômée en muséologie, docteur en sciences de l'information et de la communication, auteur d'une thèse sur la transmission des savoirs au musée soutenue à l’École Normale Supérieure de Lyon. Avant de rejoindre l'équipe en charge de la rénovation du musée d'Histoire de Marseille en 2012, elle a exercé en qualité de chargée d'évaluation des expositions à la Cité des Sciences et de l'Industrie à Paris, puis chargée d'étude pour la Direction des musées de France et consultante pour le Louvre et différents musées d'histoire et de société.
Sophie Deshayes est membre du comité éditorial de l'édition#6 du Festival Allez Savoir (2025).